Прошло 3 года как Наруто ушел с Джираем в тренировку.Он возвратился в деревню чтобы стать Хокаге и вернуть Саске.Но и враги тоже не заставили ждать.Акацуки начали действовать, сбор инфорамаций хвостатых закончилось.И началось охота на хвостатых.Гаара удалось избежать смерти, Дейдара и Сасори атаковав Суну выиграли Гаару.И извекли из него Сюкаку.Гаару спасает старейшина Чиё, Наруто и Сакура и Какаши и команда Гая.Чиё умирает спасая Гаару.Терпения Наруто кончается он хочет спасти Саске, но Цунаде не отпускает его из деревни иза Акацуки.
Тем временем Данзо уходит с деревни создавая свою организацию, цель его захватить Коноху и другие страны.Его Организация становиться проблемой для Акацуки.Лидер Акацук Мадара тайно отдает приказ Пейну.Чтобы он и все члены Акацуки уничтожали Организацию Данзо.Жестокая Война между с красным облаками или красным расцветом против белого щита.И от этой войны страдают деревни.